Чтобы выйти из тяжелого положения, была рождена идея Особой Экономической зоны. 12 января 1996 года между Российской Федерацией и субъектом Федерации - Калининградской областью был заключен "Договор о разграничении полномочий и ответственности между органами государственной власти Российской Федерации и Калининградской области". В этом договоре за Калининградской областью закреплены особые права. В сфере экономики предусматрена поддержка по следующим основным направлениям: структурные преобразования, регулирование пассажирского и грузового транзита, развитие транспортного узла, а также торгово-финансового центра с предоставлением разнообразных услуг.

Вследствие данного договора Государственная Дума России приняла Федеральный Закон "Об Особой Экономической зоне в Калининградской области" от 22 января 1996 года. Закон установил принцип государственной правовой защиты для инвестиций и предпринимательской деятельности. Кроме того, выпущено постановление Государственного Таможенного комитета № 268-р/01-16/44 от 10 июля 1997 года, в котором говорилось, что товары, ввезенные в Калининградскую область для потребления, а также товары произведенные в Калининградской области для последующего вывоза на таможенную территорию Российской Федерации, в пределы Таможенного Союза государств СНГ либо за рубеж, освобождаются от таможенных и иных платежей и не подлежат мерам внетарифного государственного регулирования внешнеэкономической деятельности в Российской Федерации. Взималась лишь таможенная пошлина за оформление в размере 0,15% от стоимости товаров. См. подробнее комментарий к Федеральному Закону "Об Особой Экономической зоне в Калининградской области" от 22 января 1996 года.

17 января 2006 года Президент России В.В. Путин подписал новый закон «Об Особой экономической зоне в Калининградской области».

Закон определяет:

• порядок управления ОЭЗ;
• порядок включения резидентов ОЭЗ (так будут называться участники инвестиционных проектов) в реестр и порядок исключения из реестра;
• порядок осуществления контроля за реализацией инвестиционного проекта;
• особенности режима свободной таможенной зоны в Калининградской области;
• критерии достаточности переработки товаров и особенности применения ставок таможенных пошлин в отношении продуктов переработки;
• особенности налогообложения;
• порядок въезда в Калининградскую область, пребывания на ее территории и выезда;
• положения о переходном периоде в отношении лиц, которые на момент принятия нового закона осуществляют свою деятельность в Калининградской области на основе закона от 22 января 1996 года.

Особая экономическая зона (ОЭЗ) создается на всей территории Калининградской области сроком на 25 лет.

Согласно закону, резидентами ОЭЗ, получающими определенные преференции в соответствии с новым законом, не могут быть юридические лица, занимающиеся добычей нефти, природного газа и оказанием услуг в этих областях, розничной и оптовой торговлей, финансовой деятельностью, ремонтом бытовых изделий и предметов личного пользования, производством этилового спирта, алкогольной продукции, табачных изделий и других подакцизных товаров, кроме легковых автомобилей и мотоциклов. См. подробнее некоторые важные подробности нового Федерального закона «Об Особой экономической зоне в Калининградской области» от 17 января 2006 года.

Закон предусматривает положения о переходном периоде, установленном сроком на десять лет со дня подписания нового закона. Он касается юридических лиц, государственная регистрация которых осуществлена в Калининградской области и которые на момент принятия нового закона осуществляли свою деятельность в Калининградской области на основе Федерального закона от 22 января 1996 года №13-ФЗ «Об Особой экономической зоне в Калининградской области» и которые могут применять таможенный режим свободной таможенной зоны в порядке, определяемом главой 3 нового Федерального закона с особенностями, установленными главой 8 нового закона.

Закон устанавливает особенности порядка въезда в Калининградскую область, выезда из Калининградской области и пребывания на ее территории. Этот порядок для иностранных граждан и (или) лиц без гражданства определяется международными договорами Российской Федерации и законодательством Российской Федерации с учетом положений принятого закона. Для въезда в Калининградскую область иностранных граждан – представителей резидентов, инвесторов, а также лиц, приглашенных для обсуждения возможностей сотрудничества в Особой экономической зоне, Правительством Российской Федерации устанавливется упрощенный порядок оформления виз, предусматривающий возможность их оформления указанным категориям иностранных граждан непосредственно в пункте пропуска через государственную границу Российской Федерации представительством федерального органа исполнительной власти, ведающего иностранными делами, на основании приглашений, оформленных в установленном порядке по ходатайству администрации.

Закон вступил в силу 1 апреля 2006 года.

Представительство Торговой Палаты Гамбурга и Делегация Немецкой экономики в Калининграде рассматривают новый закон «Об Особой экономической зоне в Калининградской области» как вторую попытку (прежний закон эту проблему так и не решил) привлечения в область крупных инвестиций, установив минимальную сумму инвестиций, получающих налоговые каникулы, в 150 млн. рублей (более пяти млн. долларов). Срок действия закона установлен на 25 лет, что значительно увеличивает уверенность в стабильности. Таможенные преференции заменены налоговыми, не подвергающимися столь резким изменениям, как таможенные. Существует мнение, что новый закон лоббирован новым правительством Калининградской области под предполагаемые крупные российские инвестиции (втом числе, не без личных контактов Губернатора области Г. Бооса) и в ближайшее время стоит ожидать определенных денежных средств из Москвы и от крупного российского бизнеса. Комментируя новый закон, Г. Боос прогнозирует резкий рост экономики области и, как следствие, уровня жизни жителей Калининградской области, который к концу 2010 года должен достичь уровня соседних стран.

Говоря об иностранных инвестициях в Калининградскую область, скорее всего не стоит ожидать их резкого роста, так как абсолютное большинство иностранных инвесторов входят на наш рынок с уставным капиталом от 50 тысяч до 1,5 млн. американских долларов.

В то же время, по оценкам специалистов, в законе не получило поддержку малое и среднее предпринимательство, являющееся в настоящее время во всех развитых странах одним из основных источников поступления налогов.