В Калининграде располагается группировка Балтийского Военно-Морского Флота России. После второй мировой войны область, отошедшая к Советскому Союзу, использовалась как военно-стратегический опорный пункт. В 1991 году регион был открыт. После распада Советского Союза произошли серьезные структурные изменения как в целом, в вооруженных силах,так и в группировке Балтийского флота, в частности. Группировка была значительно сокращена (по неофициальным данным на территории области насчитывается около 25 000 военнослужащих вместо 120 000 советского времени). В результате сокращения вооруженных сил и конверсионных мероприятий многие военные городки переданы в государственную, областную и муниципальную собственность. Вырос миграционный приток в Калининград российского населения из государств, образованных из бывших республик СССР. В первую очередь это семьи военнослужащих сокращенных воинских частей и военных пенсионеров. В область мигрировали этнические немцы из Казахстана, Кыргызстана, Поволжья и других регионов России, однако немецкая доля в составе населения Калининградской области часто преувеличивается. По результатам последней переписи населения на территории Калининградской области проживает 8,5 тысяч российских граждан немецкой национальности. В целом же национальный состав населения региона отражает все многообразие наций и народностей бывшего Советского Союза.

Сохранились некоторые остатки немецкого прошлого, памятники истории и архитектуры, сбережению которых в настоящее время придается большое значение. Инициаторами были различные немецкие благотворительные фонды и культурные организации, частные лица. Со временем эту тенденцию поддержали и местные власти. 24 октября 1998 года состоялось торжественное открытие восстановленного Кенигсбергского Кафедрального собора. С помощью пожертвований из Германии, прежде всего со стороны фонда Эбелин и Герда Буцериус "Цайт-штифтунг", удалось восстановить кровлю и колокольню, в помещениях собора открыт музей И. Канта. Завершается реставрация алтаря и большого зала, где уже проходят благотворительные концерты. Кафедральный собор вновь становится культурным центром города Калининграда. В ходе подготовки к 750-летию Кенигсберга-Калининграда отреставрированы и стали центром торжественных мероприятий ворота Королевские. Рядом с Кафедральным собором воздвигнут памятник герцогу Альбрехту. Сооружен пешеходный мост через реку Преголя.

После распада Советского Союза российское правительство резко сократило объем государственных дотаций в регионе. Начался глубокий экономический кризис. Многие предприятия, ранее производившие продукцию преимущественно для ВПК и космических нужд, потеряли основу своего существования. В то же время местные товаропроизводители столкнулись с сильной конкуренцией извне и не смогли противостоять этому давлению. Сельское хозяйство, некогда весьма значительный экономический фактор в регионе, было развалено. Немногочисленные рентабельные фермерские хозяйства не способны сегодня обеспечить внутренний рынок. Поэтому большой объём потребительских товаров в регионе импортируется.